Windows和Linus系统之间的对比有很多方面，如果只是虚拟主机系统选择，则可以简化为：网站程序语言。建站程序采用ASP.net开发，则选择Windows虚拟主机为主；建站程序采用PHP开发，则选择Linux虚拟主机为主。两者之间，没有好坏之分，只在乎谁的兼容性更好，谁的使用更方便。
Windows操作系统是一款由美国微软公司开发的窗口化操作系统，采用了GUI图形化操作模式，比起从前的指令操作系统如DOS更为人性化。Windows操作系统是目前世界上使用最广泛的操作系，但是在企业级服务应用上则是Linux系统更为专业与出名，也许听到Linux操作系统会觉得陌生，Android 操作系统（安卓）就是基于Linux平台的开源手机操作系统，在个人电脑桌面操作系统有ubuntu、centos、Fedora等都是基于linux。这个号称“全地球人的操作系统”，以其免费、安全、稳定等优点获得人们的广泛好评。
应用程序支持方面，Windows上拥有丰富的应用程序支持，而Linux也不乏力，但是对图形化应用工具而言，Linux上拥有的数量是远不及Windows的。但是反之，Linux的管理工具层出不穷，开发和生产支持的底层元件更丰富和稳定（如我们日常访问的网站后台，绝大多数都是奔跑在安装Linux的服务器上）。简言之，Linux的应用，更多是为开发者和生产环境而准备的，而Windows则更倾向于满足其庞大的家庭用户。
对于应用场景，Linux更受开发者的青睐，由于Linux系统稳定、安全、强大，非常适合作为开发环境或实际生产环境。相反，Windows则聚焦在桌面操作系统上，适合大多数的计算机用户，能提供丰富的软件服务和简单的操作方式。
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